TUNEL, SCD y SCSA: diferencias entre los test de fragmentación del ADN espermático

TUNEL, SCD y SCSA miden la fragmentación del ADN espermático con principios distintos. Umbrales de referencia, qué detecta cada técnica y cuál pedir.

Comparación visual de las tres técnicas de análisis de ADN espermático sobre fondo carbón oscuro con detalles dorados

TUNEL, SCD y SCSA son las tres técnicas principales para medir la fragmentación del ADN espermático. TUNEL detecta las roturas directamente mediante marcaje enzimático y es la más sensible para daño de cadena doble. SCD evalúa la dispersión de la cromatina con microscopio óptico convencional, sin necesitar citometría de flujo. SCSA mide cómo responde el ADN a la desnaturalización ácida y acumula el mayor cuerpo de evidencia en estudios clínicos de FIV. Las tres expresan el resultado como DFI, pero con umbrales de referencia distintos que no son intercambiables entre sí.

La fragmentación del ADN espermático es la alteración de fertilidad masculina que con más frecuencia queda sin detectar en el diagnóstico estándar. La pregunta de qué técnica usar es relevante si estás eligiendo dónde hacerte el test, si recibes un resultado y quieres saber qué valor de referencia aplicar, o si tienes resultados de distintos laboratorios que no cuadran entre sí.


Por qué existen tres técnicas distintas

La fragmentación del ADN espermático no es un fenómeno único. Es un conjunto de lesiones — roturas de cadena simple (SSB), roturas de cadena doble (DSB) y defectos en el empaquetamiento de la cromatina — que comparten el resultado clínico (peores resultados reproductivos) pero tienen orígenes biológicos distintos y son detectables con métodos distintos.

Las tres técnicas surgieron de laboratorios de investigación independientes, con enfoques instrumentales distintos y con bases de datos clínicas construidas por separado. Cada una captura el fenómeno desde un ángulo ligeramente diferente, con sensibilidades distintas para cada tipo de lesión. Los estudios comparativos muestran correlaciones moderadas-altas entre las tres — el hombre que sale elevado en una técnica generalmente también sale elevado en las otras dos — pero los umbrales de referencia no son intercambiables.

Un DFI del 25% por SCSA no equivale a un DFI del 25% por TUNEL en términos de pronóstico.


TUNEL — marcaje directo de las roturas del ADN

TUNEL (Terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end labeling) es la técnica más directa conceptualmente. La enzima TdT añade nucleótidos marcados fluorescentemente a los extremos libres 3’-OH que crean las roturas del ADN. Cuantas más roturas tiene un espermatozoide, más nucleótidos marcados incorpora y más señal registra el citómetro de flujo.

Eso hace de TUNEL la técnica más sensible para detectar roturas de cadena doble (DSB), que son las lesiones genéticamente más graves porque comprometen la integridad estructural completa del cromosoma. También detecta roturas de cadena simple. El resultado se expresa como porcentaje de espermatozoides con marcaje por encima de un umbral — habitualmente DFI >15% se considera elevado, aunque cada laboratorio puede calibrar el suyo con sus propios datos de referencia.

Ventaja principal: alta sensibilidad para DSB y cuantificación directa de las roturas mediante citometría de flujo o microscopía de fluorescencia.

Limitación principal: sensibilidad preanalítica. El protocolo de preparación de la muestra importa mucho. Una centrifugación incorrecta, un tiempo de espera excesivo o temperatura inadecuada pueden generar roturas iatrogénicas — daño introducido por el propio proceso de análisis, no por el organismo — y elevar artificialmente el DFI. Laboratorios sin experiencia en la técnica pueden dar resultados falsamente elevados. Por eso la experiencia del centro cuenta tanto como la técnica en sí.


SCD — dispersión de la cromatina sin citometría de flujo

SCD (Sperm Chromatin Dispersion) funciona por un principio completamente distinto. Los espermatozoides se someten a una desnaturalización ácida controlada seguida de lisis de las proteínas. Los que tienen ADN intacto responden produciendo un halo de dispersión de cromatina — una corona visible alrededor del núcleo espermático en microscopio óptico. Los que tienen el ADN fragmentado no producen ese halo, o producen uno muy pequeño.

El resultado se clasifica por el tamaño del halo: sin halo o halo pequeño indica fragmentación; halo mediano o grande indica ADN intacto. Esa clasificación se traduce a porcentaje de espermatozoides con halo reducido, equivalente al DFI.

El kit comercial más extendido es Halosperm (existen también Halomax y variantes equivalentes). Su ventaja más relevante en la práctica es que no requiere citómetro de flujo: se puede leer en microscopio óptico convencional. Eso hace que esté disponible en un mayor número de laboratorios de análisis clínico en España, incluyendo laboratorios que no tienen infraestructura de andrología avanzada.

Los estudios comparativos — incluyendo revisiones sistemáticas que han comparado SCD con TUNEL y SCSA — muestran una correlación alta para clasificar correctamente a los hombres como normales o elevados, aunque la concordancia de los valores numéricos absolutos entre técnicas es moderada. Para seguimiento longitudinal dentro del mismo laboratorio — comprobar si el DFI ha bajado tras una intervención —, SCD es adecuado. Para comparar valores absolutos entre laboratorios que usan técnicas distintas, la comparación directa no tiene validez.

Ventaja principal: accesibilidad. Más laboratorios en España pueden ofrecerlo sin necesidad de citometría de flujo.

Limitación principal: la clasificación visual del tamaño del halo tiene un componente subjetivo que las técnicas de citometría evitan. Requiere técnicos con experiencia en la clasificación de los patrones de dispersión.


SCSA — el estándar en investigación clínica

SCSA (Sperm Chromatin Structure Assay) fue desarrollada por Don Evenson y acumula el mayor cuerpo de evidencia clínica de las tres. Utiliza naranja de acridina (AO), un colorante que se intercala en el ADN y fluorece de forma distinta según el estado del material genético: el ADN de cadena doble intacto fluorece en rojo-naranja; el ADN desnaturalizado de cadena simple fluorece en verde-amarillo.

Antes del análisis, la muestra se somete a una desnaturalización ácida controlada. Los espermatozoides con ADN fragmentado o cromatina mal compactada se desnaturalizan más fácilmente — sus roturas de cadena simple quedan accesibles al ácido — y muestran un patrón de fluorescencia diferente al de los espermatozoides con ADN intacto. El citómetro de flujo cuantifica esa diferencia en miles de espermatozoides en pocos minutos.

SCSA reporta dos parámetros:

  • DFI (DNA Fragmentation Index): el porcentaje de espermatozoides con ADN fragmentado. Es el número que los clínicos usan para tomar decisiones.
  • HDS (High DNA Stainability): el porcentaje de espermatozoides inmaduros con exceso de histonas en lugar de protaminas. Indica problemas en el empaquetamiento de la cromatina durante la espermatogénesis — un tipo de daño distinto al DFI que algunos especialistas también evalúan.

Los umbrales de DFI establecidos con SCSA en los estudios que informan las guías clínicas son: DFI <15% como normal, 15–25% moderado, >25% como umbral de alerta en FIV, y >30% como predictor de tasas significativamente reducidas de embarazo natural. Estos umbrales se basan en los estudios originales de Evenson y en las series de FIV más grandes que han relacionado DFI con resultados clínicos — la mayoría realizados con SCSA.

Ventaja principal: el mayor cuerpo de evidencia clínica. Los umbrales de referencia más citados en guías y revisiones se establecieron con SCSA.

Limitación principal: requiere citometría de flujo. No está disponible en todos los laboratorios, aunque sí en la mayoría de clínicas de reproducción asistida y laboratorios de andrología especializados.


Comparativa: TUNEL vs. SCD vs. SCSA

TUNELSCD (Halosperm)SCSA
PrincipioMarcaje enzimático de roturas 3’-OHDispersión de cromatina tras desnaturalizaciónDesnaturalización ácida + naranja de acridina
Tipo de daño que detectaSSB + DSB (más sensible para DSB)Fragmentación y compactación deficientePrincipalmente SSB accesibles a ácido
EquipamientoCitometría de flujo o fluorescenciaMicroscopio óptico convencionalCitometría de flujo
Accesibilidad en EspañaMedia — laboratorio especializadoAlta — más laboratorios disponiblesMedia — clínicas RA y andrología
Base de evidencia para FIVAltaMedia-altaMuy alta
Umbral DFI orientativo>15%>15%>25–30%
Variabilidad preanalíticaAlta — muy sensible al protocoloMediaMedia

El umbral más bajo de TUNEL frente a SCSA no refleja que una técnica sea más estricta que la otra. Refleja que detectan conjuntos parcialmente distintos de daños y que sus umbrales se calibraron en estudios independientes contra outcomes clínicos diferentes. Por eso los valores numéricos no son comparables directamente entre técnicas.


Cuál pedir según tu situación

Si tu clínica de FIV necesita datos para tomar una decisión protocolizada: SCSA. Es la técnica sobre la que se basan la mayoría de los estudios que establecen los umbrales clínicos que los reproductólogos usan para ajustar el protocolo de estimulación, decidir entre FIV e ICSI, o plantear una biopsia testicular. Cuando el resultado va a tener consecuencias directas en un protocolo de reproducción asistida, el peso de la evidencia está del lado de SCSA.

Si tu objetivo es una evaluación inicial o un seguimiento posterior a una intervención: SCD es una opción razonable si el laboratorio tiene experiencia en la técnica. El coste suele ser menor, la disponibilidad es mayor y la correlación con las otras dos es suficiente para detectar si el DFI es elevado o si ha bajado de forma significativa después de un cambio de hábitos o de un protocolo antioxidante.

Si hay sospecha específica de daño de cadena doble: TUNEL tiene mayor sensibilidad para DSB. Esto es relevante en escenarios concretos: hombres que han recibido radioterapia pélvica, quimioterapia genotóxica o con exposición documentada a agentes alquilantes, donde el mecanismo de daño genera prioritariamente roturas de cadena doble que SCSA puede infraestimar.

Lo que importa más que la técnica en sí misma: la experiencia del laboratorio en esa técnica, y que te den sus propios valores de referencia junto con el resultado, no solo el número absoluto.

Si todavía estás evaluando cuándo pedir el test, qué esperar del procedimiento y cuánto cuesta en España, hay una guía sobre el test de fragmentación del ADN espermático que cubre esos aspectos. Para entender qué causa la fragmentación y por qué el estrés oxidativo seminal es la causa subyacente más frecuente, el artículo específico entra en el detalle bioquímico. Si tienes un DFI elevado y estás evaluando qué opciones tienes, el artículo sobre cómo mejorar la fragmentación del ADN espermático resume las intervenciones con evidencia clínica.

Si quieres profundizar en qué dicen los ensayos específicos sobre cada antioxidante — CoQ10, NAC, L-carnitina, selenio — a qué dosis muestran efecto sobre el DFI y por qué los ensayos negativos no invalidan esa evidencia, el artículo sobre antioxidantes y fragmentación del ADN: los ensayos clínicos cubre esos aspectos.


Si estás trabajando en mejorar tu seminograma, el próximo paso es conocer exactamente qué puedes hacer con esa información. Únete a la lista de Zygon para recibir acceso anticipado y la evidencia que necesitas antes de tomar ninguna decisión.


Preguntas frecuentes

¿Qué técnica da resultados más fiables?

Depende de qué se entiende por fiable. SCSA es la técnica con mayor validación clínica para predecir outcomes en FIV: la mayor parte de los estudios que relacionan DFI con tasas de embarazo se hicieron con SCSA. TUNEL es la más sensible para roturas de cadena doble. SCD es la más accesible y adecuada para seguimiento longitudinal en laboratorios sin citometría de flujo. Las tres son clínicamente útiles cuando el laboratorio tiene experiencia en la técnica que usa.

¿Por qué el umbral de SCSA es más alto que el de TUNEL?

Porque detectan conjuntos parcialmente distintos de lesiones y los umbrales se establecieron de forma independiente en estudios distintos contra outcomes clínicos distintos. Un DFI del 20% por TUNEL puede tener una implicación clínica diferente a un DFI del 20% por SCSA. Por eso los resultados de técnicas distintas no son directamente comparables como valores absolutos.

¿Puedo comparar los resultados de dos laboratorios que usan técnicas distintas?

No directamente. Si el primer análisis usó SCSA y el segundo usa TUNEL, comparar los números no es válido para detectar si ha habido mejora. Para seguimiento, lo ideal es usar la misma técnica en el mismo laboratorio. Si eso no es posible, lo que tiene sentido clínico es evaluar si cada resultado está por encima o por debajo del umbral de su técnica correspondiente, no comparar el número absoluto entre técnicas.

¿Qué es el HDS que aparece en el informe de SCSA?

El HDS (High DNA Stainability) es el porcentaje de espermatozoides inmaduros con un patrón de empaquetamiento incompleto — tienen más histonas y menos protaminas de lo normal, lo que hace que el naranja de acridina los tiña de forma diferente. Un HDS elevado indica maduración espermática incompleta durante la espermatogénesis, un tipo de daño distinto al que mide el DFI. Algunos especialistas lo consideran un predictor adicional de calidad seminal, aunque tiene menos evidencia acumulada que el DFI para la toma de decisiones clínicas.

¿Cuánto cuesta cada técnica en España?

Las tres están en un rango similar: entre €80 y €200 dependiendo del centro. SCD suele ser algo más económica por su menor coste instrumental. La disponibilidad varía: SCD está más extendida en laboratorios de análisis general; SCSA y TUNEL están más concentradas en clínicas de reproducción asistida y laboratorios de andrología especializados. La cobertura pública existe con indicación clínica documentada — abortos recurrentes, fallos de FIV — pero el tiempo de espera puede ser largo.

Escrito por Dani Ingeniero químico · Fundador de Zygon

Los espermatozoides de dentro de 3 meses se deciden hoy.

Déjanos tu email. Te avisaremos antes que a nadie cuando lancemos, con acceso anticipado y precio de fundadores.

Sin spam. Solo ciencia, avances del producto y acceso anticipado.